倘若您在进行生物信息分析时，自己的电脑频繁出现内存不足的报错，环境问题也总是让您束手无策，那不妨来瞧瞧我们的生物信息专用服务器。其拥有超多核的 CPU 与超大内存，而且可以 7*24 小时不间断运行，您无需有任何顾虑。现在注册就能免费体验 5 小时，快来尝试一下！
一.背景
很多老师和同学使用Rstudio的时候，会觉得Rstudio很卡，高性能服务器的体验甚至还不如自己电脑，造成这种情况的原因有很多,下面我将为大家分析一下情况，同时文章后面也会为大家准备相应解决方案。
二.情况
2.1情况一（Rstudio Server的设计缺陷）
我们服务器使用的是Rstudio Server，和家用办公电脑使用的Rstudio是不一样的
RStudio Server的信息传递链为：RSession -> C++ -> Java -> WebSocket -> html+js
RStudio Server的通讯过程，其中就包含了许多rpc请求
（1）. web界面上的js会向Java发送一个rpc请求，Java如果处理不过来，该请求就会阻塞，直至超时；
（2）. web界面判断未完成的任务，还会定期发送rpc/event作为心跳，与Java保持沟通；
（3）.RSession执行完后返回给c++,然后c++通过event通知Java,Java等待下次rpc/event时就会将结果呈现到web界面；
我们可以看出，RStudio目前的架构很糟糕，这种架构本身就是具有高度阻塞风险的，所以如果一旦RStudio Server界面卡顿，有以下几项措施可以尝试下：
（1）多刷新几次（千万不要整体刷新，局部刷新界面上的模块就好了），有可能Java Web阻塞了界面中的某项请求，刷新一下就能出来；
（2）RSession可能执行死掉了，重启RSession，或者直接到服务器上kill掉RSession；
2.2情况二（占用缓存过大）
同学们使用Rstudio Server时应该经常会遇到页面加载不进去，报错R is taking longer to start than usual的情况
我们知道Rstudio为了节省内存和资源，当没有对Rstudio操作一段时间后（24小时），Rstudio会把现有的session写进硬盘并释放内存空间以提高内存利用率
那么当上一次的计算缓存过大，从硬盘读写到内存的时间就会大大地延长，就会出现上诉的R is taking longer to start than usual的情况
解决办法
1.不要reload，耐心等待加载完成即可进入
2.如果需要经常使用的话，建议每天上去随便运行一两行代码防止Rstudio把session写回硬盘
3.在每次退出之前，或者挂载运算的最后一步，在Rstudio里面运行 gc() 这个命令，这个命令可以把大部分没用的缓存空间释放，可以大大提速下一次的加载速度以及运算速度。这个命令只会清除无用的缓存，并不会对计算以及结果造成任何的影响，大家可以放心运行（极力推荐此方法）
三.结束
通过上述情况我们了解到了一些有用的信息，RStudio Server 目前存在一些设计缺陷。这种情况其实我们也有一些能够避免的方式，如果有Linux基础的同学建议直接在Linux里面使用R语言，相比起使用Rstudio，在Linux里面使用R语言可以大幅度提高运算速度。
一.
# 通过FinalShell 登录服务器后 输入R命令然后去执行你的代码
R
# 然后运行您的代码二.
# 将你需要在Rstudio上运行的代码，保存为R文件
Rscript xxx.R
# 如果你的任务比较大，比较久不想等待的话您可以使用nohup命令
nohup Rscript xxx.R &
# 命令执行后会在当前目录下生成一个日志文件 nohup.out（查看命令如下）
tail -f nohup.out