一.为什么是conda
conda 是一个流行的开源软件包管理系统和环境管理系统,主要用于科学计算、数据分析和机器学习领域。
二.解决了什么问题
包管理 ( Conda 允许用户创建和管理多个独立的环境,每个环境可以有自己的软件包集合和版本,从而使得不同项目之间的依赖关系隔离开来,避免了版本冲突和不一致性的问题。)
环境管理(每个环境可以有自己的软件包集合和版本,从而使得不同项目之间的依赖关系隔离开来,避免了版本冲突和不一致性的问题。)
三.如何安装conda
3.1下载安装脚本
cd ~
wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -O conda_install.sh
3.2安装
bash conda_install.sh
3.3过程
# 安装之前同意相关协议
回车
q
yes
回车
yes
键盘-回车
键盘-q
键盘-yes
键盘-回车
键盘-yes
3.4更新环境变量+删除无用脚本
#使以上的安装立即生效
source ~/.bashrc
3.5检查是否安装
conda env list
3.6删除无用脚本
# 删除无用的安装包
rm conda_install.sh
四.常用命令
# 创建环境并指定环境中的 Python 版本
conda create --name myenv python=3.8
# 查询conda环境列表
conda evn list
# 选择切换环境
conda activate myenv
# 安装软件
conda install numpy
# 安装特定版本软件
conda install numpy=1.19.2
# 更新软件
conda update numpy
# 搜索出软件可用版本
conda search tensorflow
五.如何conda切换源
# 添加中科大源
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes
# 添加清华大学源
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
conda config --set show_channel_urls yes
# 添加阿里云源
conda config --add channels https://mirrors.aliyun.com/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.aliyun.com/anaconda/pkgs/main
conda config --add channels https://mirrors.aliyun.com/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.aliyun.com/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
# 添加北京外国语大学源
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/
conda config --set show_channel_urls yes
# 设置搜索时显示通道地址
conda config --set show_channel_urls yes
# 检查是否正常添加,channel的顺序很重要,添加完上述源后的.condarc 文件内容示例:
cat ~/.condarc
channels:
- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
- https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
- https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
- https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
- https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
- bioconda
- conda-forge
- r
- defaults
show_channel_urls: true
# 清除搜索软件源时的本地索引,这样会基于新配置后的软件源生产一份全新的索引
conda clean -i
六.最后
学习生信的小伙伴们快看过来,看看你们是否有以下问题:
环境不会装,身为 Linux 小白是不是从入门就开始抓瞎,甚至直接放弃? 专业技术帮助
数据太大,自己的电脑完全跑不动? 服务器级别性能支持
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